 Ahmed, Mamdoh Ewis Esmael: Detection and effects of latent contamination of potato tubers by soft rot bacteria, and investigations on the effect of hydrogen peroxide on lipopolysaccharides of Erwinia carotovora in relation to acquired resistance against biocides
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Sachgruppe der DNB Dissertation zur Erlangung des Doktortitels, angenommen von: Georg-August-Universität Göttingen, Fakultät für Agrarwissenschaften, 2001-11-22 Abstract (english)
For a sensitive detection of latent contamination of potato tubers by soft rot causing erwinias [Erwinia
carotovora subsp. atroseptica (Eca), and Erwinia carotovora subsp. carotovora (Ecc)], the semi-selective double
layer medium of Bdliya (1995) was improved resulting in a detection limit as low as 2 X 10 1 cfu/ml. Field
experiments proved that seed potato lots assessed as moderately or strongly contaminated by Ecc gave lower
yields and less quality than potato lots assessed as weakly contaminated. By applying PCR and the primer
setsY1/ Y2 or Eca1f /Eca2r the detection limit of Eca in potato peel extract was 10 2 cfu/ml. Field experiments
with seed potatoes treated with Degaclean revealed a reduced germination rate of the treated potatoes and
increased percentage of tubers with soft rot, so that yields after treatment of seed potatoes were reduced. The
repeating unit of the LPS-O-chain of Ecc 436 was elucidated as a tetrasaccharide of the following structure:
The repeating unit of the O-chain of Eca 2967 was identified as a pentasaccharide containing three galactose molecules, one rhamnose and a new higher branched sugar (similar to caryophyllose). The Eca-strain 2962 with a rough LPS was very weakly virulent. Abstract (deutsch)
Fur einen empfindlichen Nachweis der latenten Kontamination von Kartoffelknollen mit Weichfaule erregenden
Erwinien [Erwinia carotovora subsp. atroseptica (Eca) und Erwinia carotovora subsp. carotovora (Ecc)] wurde
das semi-selektive Zweischichten-Medium von Bdliya (1995) so verbessert, dass die Nachweisgrenze nur 2 X 10 1
cfu/ml betrug. Feldversuche ergaben, dass Saatkartoffel-Partien, die als mittel oder stark mit Ecc kontaminiert
eingestuft worden waren, nach der Ernte niedrigere Ertrage von schlechterer Qualitat ergaben als schwach
kontaminierte Partien. Bei Anwendung der PCR mit den Primer-Paaren Y1/Y2 oder Eca1f /Eca2r betrug die
Nachweisgrenze von Eca in Kartoffelschalen-Extrakten 10 2 cfu/ml. Feldversuche mit Saatkartoffeln, die mit
Degaclean behandelt worden waren, ergaben eine verminderte Keimungsrate der behandelten Kartoffeln und
einen erhohten Anteil von Kartoffeln mit Weichfaule, so dass die Ernteertrage deutlich reduziert waren. Die
Wiederholungseinheit der LPS-O-Kette von Ecc 436 wurde als ein Tetrasaccharid mit folgender Strukturformel
aufgeklart:
Die Wiederholungseinheit der LPS-O-Kette von Eca 2967 wurde als ein Pentasaccharid identifiziert, das drei Galaktose-Molekule, ein Rhamnose-Molekul und einen neuen starker verzweigten Zucker (ahnlich der Caryophyllose) enthielt. Der Eca-Stamm 2962 mit rauher LPS war nur sehr schwach virulent.
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