DARWIN Digitale Dissertationen English Version Strich

FU Berlin
Digitale Dissertation

Francisco Ylera Dahmen :
Selektion hochaffiner RNA-Moleküle gegen das Alzheimer beta-Amyloid
Selection of high-affinity RNAs for the Alzheimer´s beta-amyloid

FU Logo


|Zusammenfassung| |Inhaltsverzeichnis| |Ergänzende Angaben|

Zusammenfassung

Die Ursache der Alzheimer-Krankheit ist immer noch unbekannt, jedoch ist sie nach dem derzeitigen Kenntnisstand eng verknüpft mit der Ablagerung des Amyloid-Peptids im Gehirn der Patienten. Daher spielt das Amyloid bei der Suche nach Medikamenten und Diagnostika eine entscheidende Rolle. Durch Einsatz der RNA-Technologien sollte mit dieser Arbeit ein Hilfsmittel für die weitere Untersuchung der Alzheimer-Krankheit zur Verfügung gestellt werden. Die in vitro-Selektion erlaubt das Design von spezifischen Nukleinsäuren gegen fast jedes Zielmolekül. Damit ist zu den Antikörpern eine neue Stoffklasse getreten, mit der man einige Probleme der Antikörper umgehen kann. Vor allem die chemische Synthese der Nukleinsäuren erlaubt eine maßgeschneiderte Modifizierung wie z. B. den Einbau von Reportermolekülen, wodurch sie sich hervorragend eignen für analytische und diagnostische Aufgaben. Da eine Veränderung des Amyloid-Gehalts im Blut von Alzheimer-Patienten beschrieben wurde, wäre ein Einsatz von Aptameren für eine Diagnose denkbar. Weiterhin wurden bereits Antikörper vorgestellt, die eine Aggregation des Amyloids zu den senilen Plaques verhindern kann. Auch hier wäre ein Einsatz von Aptameren vorstellbar.

Mit Hilfe der Methode der in vitro-Selektion wurde aus einer kombinatorischen RNA-Bibliothek mit ca. 1015 unterschiedlichen Molekülen hochaffine RNA-Aptamere gegen das Amyloid b A4(1-40) und ein Fragment b A4(1-16) isoliert. Dazu wurde eine DNA-Bibliothek mit 70 randomisierten Nukleotiden chemisch synthetisiert und für die Selektion in RNA transkribiert. Nach 8 Selektionszyklen, bestehend aus Selektion und Amplifikation, konnten affine Moleküle isoliert werden. Die apparenten Dissoziationskonstanten dieser Aptamere liegen bei 29-48 nM für das lange Peptid bzw. 758 nM für das kurze b A4(1-16) Fragment. Die für das Amyloid erhaltenen Aptamere liegen in dem Bereich der besten für Peptide bisher isolierten Aptamere, während für kleinere, flexiblere Peptide häufig Aptamere im mikromolaren Bereich beschrieben wurden.

In dieser Arbeit wurden Wege zu neuen Hilfsmitteln für die Untersuchung und Diagnose der Alzheimer-Krankheit vorgestellt. Nun sollten diese Aptamere auf ihre Wirksamkeit überprüft werden, um dann eine Verkürzung der Sequenzen und eine Modifizierung der RNA zur Stabilisierung gegenüber RNasen anzuschließen.


Inhaltsverzeichnis

Die gesamte Dissertation können Sie als gezippten tar-File oder als zip-File laden.

Durch Anklicken der Kapitelüberschriften können Sie das Kapitel in PDF-Format laden:

Titel, Inhaltsverzeichnis

1 Einleitung

1.1 Morbus Alzheimer

1.2 RNA

1.3 In vitro-Selektion

1.4 Stabilisierung von RNA

1.5 Vergleich von Aptameren und Antikörpern

2 Aufgabenstellung

3 Methoden

3.1 Chemische Nukleinsäuresynthese

3.2 Aufreinigung von Nukleinsäuren

3.3 Molekularbiologische Methoden

3.4 Vorbereitung der Affinitätschromatographie

3.5 Mikrobiologische Methoden

3.6 Charakterisierung der Aptamere

4 Ergebnisse

4.1 Immobilisierung der Peptide

4.2 In vitro-Selektion

4.3 Charakterisierung der Aptamere

5 Diskussion

6 Zusammenfassung

7 Summary

8 Literaturverzeichnis

Anhang

A Geräte, Enzyme und Chemikalien

B Puffer und Medien

C Lebenslauf

D Eigene Publikationen


Ergänzende Angaben:

Online-Adresse: http://www.diss.fu-berlin.de/1999/33/index.html
Sprache: Deutsch
Keywords: selex, in vitro selection, aptamer, alzheimer´s disease, amyloid, RNA
DNB-Sachgruppe: 30 Chemie
Datum der Disputation: 29-Apr-99
Entstanden am: Fachbereich Biologie, Chemie, Pharmazie, Freie Universität Berlin
Erster Gutachter: Prof. Dr. Volker A. Erdmann
Zweiter Gutachter: Prof. Dr. Brigitte Wittmann-Liebold
Kontakt (Verfasser): ylera@email.com
Kontakt (Betreuer): erdmann@chemie.fu-berlin.de
Abgabedatum:09-Jun-99
Freigabedatum:16-Jun-99

 


|| DARWIN|| Digitale Dissertationen || Digitale Dissertationen : Autoren A-Z || Dissertation|| English Version|| FU Berlin|| Seitenanfang ||


Mail-Icon Fragen und Kommentare an:
darwin@inf.fu-berlin.de

© Freie Universität Berlin 1999