FU Berlin Digitale Dissertation
Peter Orth : Mechanism of Regulation of the Tetracycline-Repressor Regulationsmechanismus des Tetrazyklin-Repressors
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Abstract

Table of Contents Download the whole PhDthesis as a zip-tar file or as zip-File For download in PDF format click the chapter title Titelseite und Inhaltsverzeichnis 1 Einleitung 1.1 Antibiotika 1.2 Das Antibiotikum Tetrazyklin 1.3 Regulation des Efflux-Mechanismus in Enterobakterien 1.4 Regulatorische Funktion des Tetrazyklin-Repressors 1.5 Induktionsmechanismen bakterieller Repressoren 1.6 Zielsetzung 2 Materialien und Methoden 2.1 Materialien 2.2 Biochemische Methoden 2.3 Kristallographische Methoden 3 Ergebnisse 3.1 Das Expressionssystem 3.2 Kristallisation 3.3 Messung von Beugungsdaten 3.4 Strukturlösung mit molekularem Ersatz 3.5 Kristallographische Verfeinerung 4 Strukturanalyse 4.1 Hauptkettenverlauf und Temperaturfaktoren des freien TetRD 4.2 Kristallpackungen 4.3 Unterschiede in den Sekundärstrukturen 4.4 Strukturvergleich von freiem und induziertem TetR 4.5 Strukturvergleich von freiem TetR und TetRD /15mer-DNA 4.6 Beweglichkeit entlang der Dimerisierungsfläche 4.7 Die Induktorbindungstasche 4.8 Die Magnesiumskoordinationsstelle 4.9 Strukturanalyse von Punktmutanten 4.10 TetRD im Komplex mit 4epiTc und 2nitriloTc 4.11 Repressor/Operator-Kontakte 4.12 Die Struktur der Operator-DNA 4.13 Orientierung des HTH-Motivs zur DNA 4.14 Strukturmodell der DNA-Kontrollregion der Resistenzdeterminante D 5 Modell des Induktionsmechanismus 5.1 Der Informationsweg des Induktionssignals 5.2 Die drei [MTc]+-bindenden Gruppen 5.3 Der "Falltür"-Verschluss der Bindungstasche 5.4 Das "katalytische Zentrum" - die Helix 6 5.5 Der "Hebel" - die Helix 4 5.6 Die "Federn" - die Helizes 5, 7 und 8 5.7 Orientierung und Abstände der DNA-Bindungsmotive Literatur Anhang Titelseite Danksagung Zusammenfassung Akürzungsverzeichnis Inhaltsverzeichnis Lebenslauf Eigene Veröffentlichungen

More Information:
Online available:	http://darwin.inf.fu-berlin.de/1998/12/indexe.html
Language of PhDThesis:	german
Keywords:	crystal structure analysis; protein/DNA-complex; transcriptional regulation; tetracycline; gram-negative bacteria
DNB-Sachgruppe:	30 Chemie
Date of disputation:	10-Sep-1998
PhDThesis from:	Fachbereich Biologie, Chemie, Pharmazie, Freie Universität Berlin
First Referee:	Prof. Dr. Wolfram Saenger
Second Referee:	Prof. Dr. Hans Hartl
Contact (Author):	orth@chemie.fu-berlin.de
Contact (Advisor):	saenger@chemie.fu-berlin.de
Date created:	10-Dec-1998
Date available:	31-Dec-1998

 

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