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FU Berlin
Digitale Dissertation

Ulf Ellwanger :
Application of Artificial Neural Networks for Prognosis Estimation of Follow-Up Data
Anwendung künstlicher neuronaler Netze für die Prognoseschätzung bei Verlaufsdaten

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Abstract

Application of modern computational methods for the analysis of right censored follow-up data is subject of this thesis. Major question is the prognosic quality of statistical methods in comparison to artificial neural networks. Analyses were performed using Kaplan-Meier estimates, classification and regression trees, Cox proportional hazards regression and artificial neural networks with two units in the hidden layer and artificial neural networks with ten units in the hidden layer. In a first step the four methods were compared using simulated data. In a second step data from the German Malignant Melanom Registry of the German Dermatological Society were analyzed with minor differences in prognosic quality for the different methods. The results demonstrate that the used artifical neural networks can not replace statistical methods for the analysis of censored follow-up data. In future, artificial neural networks may be used for quality check of statistical methods.

Table of Contents

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Titelblatt1
Gutachter2
Inhaltsverzeichnis3
1.Einleitung6
1.1Einführung in die Grundbegriffe neuronaler Netze8
1.1.1Aufbau künstlicher neuronaler Netze8
1.1.2 Neuronen als kleinste Einheit künstlicher neuronaler Netze9
1.1.3 Beispiel eines neuronalen Netzes10
1.1.4 Topologien neuronaler Netze11
1.1.4.1 Netze ohne Rückkopplung (feedforward-Netze)11
1.1.4.2 Netze mit Rückkopplung (feedback-Netze)12
1.1.5 Lernregeln12
1.2 Eigenschaften neuronaler Netze14
1.3 Angaben zur Geschichte der künstlichen neuronalen Netze14
1.4 Neuronale Netze und Statistik15
1.5 Neuronale Netze und statistische Regression16
1.6 Prognosemodelle und individuelle Prognose16
1.7 Methoden für die Analyse zensierter Verlaufsdaten16
1.7.1Kaplan-Meier-Überlebenskurven und der Log-Rank-Test17
1.7.2Klassifikations- und Regressionsbäume für zensierte Daten19
1.7.3Das Cox-Proportional-Hazards-Modell20
1.7.4Erweiterungen des Cox-Modells21
1.7.5Verwendung von Splines in der Cox-Regressionsanalyse21
1.7.6Parametrische Modelle für zensierte Verlaufsdaten21
1.7.7Neuronale Netze für die Analyse zensierter Verlaufsdaten21
1.8Beispiele für die Verwendung neuronaler Netze bei der Analyse zensierter Verlaufsdaten22
1.9Verwendung simulierter und realer Daten23
1.10Multivariable Modellbildung23
1.10.1 Vorbereitende Schritte23
1.10.2 Datenreduktion23
1.10.3 Überprüfung von Modellannahmen24
1.10.4 Quantifizierung der Vorhersagegenauigkeit25
1.10.5 Methoden für die Modellvalidierung26
1.11 Kurze Übersicht über die Prognose bei Melanompatienten27
1.12Fragestellungen und Hypothesen30
2.Methoden31
2.1Beschreibung der verwendeten Daten32
2.1.1Simulierte Daten32
2.1.2Registerdaten32
2.2Durchführung der Analysen32
2.3Kaplan-Meier-Schätzung und Log-Rank-Test33
2.4CART-Analyse für zensierte Daten33
2.5Multifaktorielle proportionale Hazard-Regressionsanalyse33
2.6Neuronale Netze für zensierte Verlaufsdaten33
2.7Generierung neuer Werte bei fehlenden Angaben34
2.8Vergleich der Klassifikationsgüte der Modelle34
2.9Software für die Analysen35
2.9.1Statistikprogramme für Prognoseschätzungen35
2.9.2Statistikpaket S-Plus35
2.9.3Statistikpaket R36
2.9.4Simulationen mit dem Stuttgarter Neuronale Netze Simulator (SNNS)36
3.Ergebnisse38
3.1Analyse der simulierten Daten38
3.1.1Kaplan-Meier-Kurven und Log-Rank-Tests bei den simulierten Daten38
3.1.2CART-Analyse44
3.1.3Cox-PH-Analyse46
3.1.4Künstliche neuronale Netze48
3.1.5Vergleich der Ergebnisse bei den simulierten Daten50
3.1.6Beschreibung der simulierten Daten56
3.2Analyse der Melanomdaten ohne Fälle mit fehlenden Angaben62
3.2.1Kaplan-Meier-Kurven und Log-Rank-Tests62
3.2.2CART-Analyse67
3.2.3Cox-PH-Analyse69
3.2.4Künstliche neuronale Netze74
3.2.5Vergleich der Ergebnisse bei den Registerdaten75
3.2.6Vergleich der Rang-Korrelationen bei Registerdaten81
3.3Analyse der Daten mit ersetzten Angaben82
3.3.1Ersetzen fehlender Angaben82
3.3.2Kaplan-Meier-Kurven und Log-Rank-Test85
3.3.3CART-Analyse85
3.3.4Cox-PH-Analyse88
3.3.5Künstliche neuronale Netze88
3.3.6Vergleich der Ergebnisse bei den vervollständigten Registerdaten88
4.Diskussion96
4.1Beispiele für die Anwendung künstlicher neuronaler Netze bei der Analyse von Verlaufsdaten96
4.1.1Simulierte Daten96
4.1.2Daten von Melanompatienten97
4.1.2.1Prognostische Faktoren bei Melanompatienten97
4.1.2.2Einordnung der Ergebnisse der Analyse mit künstlichen neuronalen Netzen im Vergleich zu statistischen Methoden98
4.1.3Anwendungsbeispiele aus der medizinischen Forschung98
4.2Kritik an der Verwendung künstlicher neuronaler Netze bei der Analyse von Verlaufsdaten101
4.2.1Probleme beim Vergleich von Prognosemodellen102
4.2.2Methoden zum Vergleich von Prognosemodellen102
4.3Neue Erkenntnisse durch die Verwendung künstlicher neuronaler Netze bei der Analyse von Verlaufsdaten102
4.4Weitere Forschung102
5.Zusammenfassung104
6.Literaturverzeichnis105
7.Anhang117
7.1Abkürzungen und Spezialbegriffe117
7.2Abbildungsverzeichnis118
7.3Tabellenverzeichnis120
7.4Programm zur Datensimulation121
7.5Beispiele für S-Plus-Auswertungsprogramme122

More Information:

Online available: http://www.diss.fu-berlin.de/2002/58/indexe.html
Language of PhDThesis: german
Keywords: survival analysis neural network
DNB-Sachgruppe: 14 Soziologie, Gesellschaft
Date of disputation: 21-Nov-2001
PhDThesis from: Fachbereich Politik- u. Sozialwissenschaft, Freie Universität Berlin
First Referee: Prof. Dr. Horst Skarabis
Second Referee: Prof. Dr. Johannes Gordesch
Contact (Author): ue@datinf.de
Contact (Advisor): skarabis@zedat.fu-berlin.de
Date created:16-Apr-2002
Date available:22-Apr-2002

 


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